La trépanation est une technique de perçage qui consiste à pratiquer un trou en réalisant une découpe circulaire à l'aide d'un outil plus petit. C'est également le nom générique d'une opération chirurgicale qui consiste à pratiquer un trou, grâce à un appareil — de type foret — appelé  trépan (voir l’image), dans le crâne. Notamment pour soulager une hypertension dans la boîte crânienne.

La trépanation est la forme la plus ancienne de  chirurgie dont il existe des preuves réelles. L'examen de crânes  fossiles montre que des opérations de ce type étaient réalisées dès le  Néolithique.